Browsing by Author "Yao-Ming Chang"
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Item 人類微核醣核酸、目標基因與同源體之預測(2010) 張耀明; Yao-Ming Chang微核醣核酸(microRNAs)是一種長度大約22個鹼基的核醣核酸物質。它可以透過鹼基序列互補的特性抑制特定的目標基因以達到減少蛋白質生成的目的。大部分的人類基因都被發現可能是微核醣核酸的目標基因。許多研究也發現微核醣核酸在生物中扮演非常重要的角色。我們的研究主要著眼於兩個主題:未知的微核醣核酸之預測與微核醣核酸同源序列(homolog)之預測。透過這兩個研究主題我們可以對於微核醣核酸之起源與演化過程有更多的了解進而對相關的問題提出解決方案。 在第一部分的研究中,我們發展了一個新的微核醣核酸預測方法,有別於先前的研究,此方法不用跨物種保守的資訊。我們先找出在某些組織特有表現的基因(tissue-selective genes),並於這些基因的3’UTR序列中找出頻繁出現的序列模式(frequent motif)。透過這些頻繁序列模式,我們找到許多已知微核醣核酸的目標基因。接著我們更利用這些頻繁序列預測出未知的微核醣核酸。在我們的預測結果中,有一部份也已經透過實驗的證實為真實的微核醣核酸。這樣高成功率的預測也大大地降低實驗所需的時間與成本。 第二部分的研究中,我們提出了一個新的方法在其他物種當中發掘更多可能是人類微核醣核酸的同源序列。透過成熟微核醣核酸(mature miRNA)序列在其他物種基因組中的搜尋之後,我們接著利用一些微核醣核酸結構與系列上的特性當作過濾條件得到許多之前未知的同源序列。在我們的結果中發現,許多人類的微核醣核酸同源序列在動物的祖先基因組中可能就已經出現。