Browsing by Author "Yun-Cheng Tian"
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Item ChemiRs - 化學物質、微核糖核酸對人體健康影響之網路應用系統(2012) 田耘政; Yun-Cheng Tian微核糖核酸(microRNA, miRNA)是一種長度約22個核苷酸,具有高度保守性的單股非編碼RNA(non-coding RNA, ncRNA),其在生物體中扮演相當多樣且重要的基因調控角色。目前約有1500種不同的miRNA在人體內被發現並記錄,並且有多種預測miRNA目標基因的演算法,然而卻缺乏miRNA、環境化合物與人體健康關聯性的資料庫或演算法。環境中的多種化學物質對於我們的健康與生活產生很大的影響,部分化學物質會藉由參與生物體內的作用機制對疾病發生產生影響。為了發展一套關於miRNA與化學物質間關聯性的可信預測方法,此應用平臺會比較化學物質影響的基因與miRNA目標基因,並通過生物途徑,找出化學物質、miRNA與人體健康之間可能的關聯。此應用平臺的目標是預測化學物質、miRNA、生物途徑之間的交互作用或關聯性。藉由文獻探討,我們獲得關於miRNA、化學物質對人體基因的影響,並藉由miRNA目標基因(Target genes)預測方法找出miRNA與基因間可能的關聯性。這些基因會再進行生物途徑(pathway)分析,找出在人體中可能的影響範圍與作用機制。此平臺由三個部分構成:(1)關聯性資料庫:資料庫中將目前現已被確認出的基因、miRNA、疾病、基因本體論與生物途徑儲存並建立起關聯性。(2)通用網關介面(Common gateway interface, CGI):CGI處理使用者輸入的資訊,從資料庫中取得所需資料並處理以提供使用者所需的訊息(3)使用者介面:使用者介面提供使用者輸入搜尋條件並獲得所需資訊的管道。此平臺可以協助研究人員預測環境化學物質與microRNA對於人體健康的影響,進一步減少在尋找研究題材時耗費的時間、人力成本與資源。